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Nuestro aporte metolológico a este tipo de estudios ha sido el empleo del análisis aglomerativo (cluster analysis). El análisis aglomerativo es una importante herramienta de clasificación utilizada en diferentes campos y disciplinas científicas; en lingüística areal americana, por ejemplo, ha sido utilizada por Constenla (1991). Sin embargo, no tenemos noticia de su empleo en estudios sobre biotaxonomías, área en la que esta herramienta puede ser de una gran utilidad, pues, a nuestro juicio, ofrece las siguientes ventajas: facilita el manejo de un corpus muy amplio, sirve para corroborar la diferenciación de todos los taxones, permite encontrar agrupaciones o taxones que no se habían previamente contemplado y se adapta a la metodología del análisis componencial al analizar valores binarios, o sea, de presencia/ausencia. Por ejemplo, en una matriz de variables y elementos, en lugar de usar el símbolo «+» usamos el valor «1» y en lugar del símbolo «-» el valor «0».
Existen diversos métodos matemáticos para este tipo de análisis que requieren generalmente de la mediación de la computadora, debido a la cantidad de cálculos que tienen que realizarse. El análisis aglomerativo produce un dendograma que refleja los grupos jerárquicos encontrados. En nuestro caso usamos el algoritmo conocido como UPGMA – Unweighted pair-group average, que agrupa los conjuntos en dos grupos con base en la distancia entre todos los miembros. Como medida hemos usado la distancia euclidiana (euclidean), por ser la medida más extendida y utilizada en este tipo de análisis. En la distancia euclidiana, los valores se dividen por la raíz cuadrada del número de variables y la distancia se convierte en similaridad o semejanza cambiando de signo.